Thèses
Messali Hadj 1898-1974, (soutenue en 1978)
Sociologie du nationalisme algérien, L’Analyse sociologique par l’approche biographique, (soutenue en 1984)
Histoire politique de l’immigration algérienne en France 1922-1962, (Thèse d’Etat, 1991).
Ouvrages :
Dictionnaire biographique de militants nationalistes algériens. 600 portraits, L’Harmattan, Paris 1985.
Messali Hadj. Pionnier du nationalisme algérien. L’Harmattan, 1986.
Les sources du nationalisme algérien. Parcours idéologiques. Origine des acteurs. L’Harmattan, 1988.
Les sources du nationalisme algérien, L’Harmattan, Paris 1989.
L’histoire de l’Algérie coloniale 1930-1954, La Découverte, Paris 1991.
Histoire de la guerre d’Algérie, 1954-1962. La Découverte, 1991.
La gangrène et l’oubli. La mémoire de la guerre d’Algérie. La Découverte, 1991.
Ils venaient d’Algérie. L’immigration algérienne en France, 1912-1992. Fayard, 1992.
Aide-mémoire de l’immigration algérienne, chronologie (1922-1962). Bibliographie. L’Harmattan, 1992.
Histoire de l’Algérie depuis l’indépendance (1962-1988), Repères/La Découverte, Paris 1995.
Ferhat Abbas, une utopie algérienne (avec Zakya Daoud). Denoël, Paris, 1995.
Dictionnaire des livres de la guerre d’Algérie. L’Harmattan, 1996.
Imaginaires de guerre, Algérie-Viêt Nam en France et aux Etats-Unis, Paris La Découverte 1997 (ISBN 2-7071-4308-1)
Le transfert d’une mémoire. La Découverte, 1999.
Algeria : A Short History, 1830-2000. Cornell University Press, 2001.
La guerre invisible : Algérie, années 90, Presses de Sciences-Po, Paris 2001.
Algérie-Maroc, Histoires parallèles, destins croisés. Maisonneuve Larose, 2002.
La dernière génération d’Octobre, Stock, Paris 2003. [Une autobiographie politique]
Histoire de la guerre d’Algérie 1954-1962, La Découverte, Paris 2004 (dernière édition).
Dictionnaire des livres de la guerre d’Algérie (1955-1995). 2300 résumés, Presses Universitaires du Mirail 2005 (ISBN 2-8581-6777-X)
Sous la direction de Mohammed Harbi et Benjamin Stora, La Guerre d’Algérie - 1954-2004, la fin de l’amnésie, Robert Laffont, Paris 2004.
Les trois exils, Juifs d’Algérie, Stock, Paris 2006 (ISBN 2-2340-5863-5)
Histoire de l’Immigration (avec E. Temine), Hachette Paris 2007 (ISBN 2-0123-7261-9)
La guerre des mémoires - La France face à son passé colonial (entretiens avec T. Leclère), éditions de l’aube, 2007.
Sur le site d’ESSF :
STORA Benjamin - 10 novembre 2004, Aux origines de « la guerre d’Algérie »
http://www.europe-solidaire.org/spip.php?article6502
STORA Benjamin - 10 juin 2004, De Diên Biên Phu aux Aurès
http://www.europe-solidaire.org/spip.php?article2236